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水稻种子在其生长期和收获贮藏期间，常感染和携带多种病原菌，如水稻恶苗病和干尖线虫病、稻瘟病、白叶枯病、细菌性条斑病、稻曲病等病菌，其中一些病原菌是田间发病的初次侵染源，经种子消毒后可明显推迟这些病害的田间初见期和减轻这些病害的发生。然而，有一些病害则以苗期为主要侵染时期，如水稻恶苗病和水稻干尖线虫病等，当田间发病以后已基本无药可治，只有在水稻播种前，通过种子消毒才能够有效地控制。因此，在水稻播种前进行种子消毒处理是一项事半功倍和经济有效的方法。近年来，盈江县部分地区以水稻稻瘟病、恶苗病为主的种传病害发生较重，其根本原因：一是对在水稻播种前进行种子消毒处理的重要性没有引起充分重视，未进行种子消毒处理；二是种子处理药剂选择不当，这些药剂不能有效控制病害发生；三是对所用种子处理药剂使用技术没有到位，不能充分的发挥这些药剂的控病效果。因此，要有效地控制水稻稻瘟病、恶苗病和干尖线虫病等种传病害发生，其关键是选择对口种子处理药剂和正确掌握其使用技术。
水稻种子在播种前的发芽试验、晒种、选种、消毒浸种、催芽等环节通常叫做种子处理技术。
目的是使种子后熟、干燥，便于浸种 吸足水分；利用太阳的热量和短光波，散发种子在贮藏期间产生的湿气和二氧化碳，同时增强稻种透气性和吸水性，促使酶活化，来提升发芽率和发芽势，达到出苗整齐一致。
选种可以去秕留饱，缩小种子间质量差异，使种子萌发整齐，幼苗健壮。选种的方法很多，一般用清水选。
水稻生长过程发生的病害，很多是通过种子传染的，如稻瘟病、恶苗病、白叶枯病、胡麻叶斑病、干尖线虫病等。因此，选种后还要消毒，以消灭附着在种子表面和潜伏在稻壳与种皮之间的病菌。具体方法：用强氯精2克（1包），兑水2公斤可浸1公斤稻种，水超过2寸为宜，浸种24小时，取出用清水冲洗2至3次，洗净后催芽播种。
浸种后，有的直接将种子播于秧田。但不如催芽后再播种，出苗整齐，幼苗生长迅速，缩短秧田时期，减免自然灾害的不利影响，有利于培育壮秧，防止烂种。催芽方法，因热源和保温方法不一样，可分为堆堆催芽、温床催芽、木桶催芽、塑料薄膜催芽等。催芽要求“早、齐、匀、壮”。“早”要求23天之内出苗；“齐”要求发芽率达到8590% 以上；“匀”指白芽长短一致；“壮”指根芽粗壮。
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